В настоящее время Московским зоопарком подготовлена новая концепция развития учреждения на территории Москвы с учетом мирового опыта.

Названной концепцией вывод зоопарка с исторической территории, на которой более 150 лет размещаются вольеры, пруды, павильоны, скульптурные изображения и другие постройки старейшего в России зоопарка не предусматривается.
Проведение строительства и реконструкции объектов Московского зоопарка непрерывно продолжается. Перечень планируемых мероприятий постоянно дополняется.
Так, в 2015 году завершено выполнение 1 и 2 пусковых комплексов работ по благоустройству территории Московского зоопарка.
Адресной инвестиционной программой города Москвы на 2015-2018 годы, утвержденной постановлением Правительства Москвы от 30.09.2015 № 630-ПП, предусмотрены лимиты бюджетных ассигнований на:
- оплату выполненных работ по Оранжерее Московского зоопарка;
- благоустройство территории Московского зоопарка (3 п.к.) – 2015г.;
- восстановление инженерных коммуникаций Московского зоопарка – 2015г.;
- строительство входа в Московский зоопарк со стороны станции метро "Баррикадная" (ул. Баррикадная, д. 4) – ввод 2017г.;
- пешеходный мост в Московском зоопарке через ул. Б. Грузинскую – ввод 2017г.;
- проектирование и строительство с вводом в 2019 году автостоянки возле Московского зоопарка;
- зоопитомник по воспроизводству редких животных, поселок Сычево Волоколамского района Московской области;
- укрупненные мероприятия по развитию сети государственных учреждений города Москвы, в том числе на объекты "Второй очереди строительства зоосада в вотчине Деда Мороза" (в 8 км от г.Великий Устюг Вологодской области), реконструкцию павильона "Ластоногие" в Московском зоопарке.
Кроме краткосрочных планов, Департаментом культуры города Москвы совместно с руководством Московского зоопарка прорабатываются предложения в долгосрочную программу развития учреждения, в том числе и по развитию Зоопитомника, расположенного в поселке Сычево Волоколамского района Московской области.
В ближайшие годы в соответствии с Концепцией развития ГАУ "Московский зоопарк" и Государственной программой города Москвы "Культура Москвы на 2012-2018 годы" на территории Зоопитомника общей площадью 240 га предполагается создать Сафари-парк, функционирующий в режиме открытого природного пространства, аналогичный известным природным комплексам, созданным в странах Европы, Азии и Америки.